MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci Mat116

Total Repeats: 3558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020248	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020248	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020248	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020248	TTC	2	6	1147	1152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020248	GAA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020248	T	8	8	2617	2624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020248	TAT	2	6	3060	3065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020248	ATT	3	9	3075	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020248	TTG	3	9	3084	3092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020248	T	6	6	3104	3109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020248	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020248	TTG	2	6	5351	5356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020248	AATC	2	8	5416	5423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020248	ACA	2	6	6551	6556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020248	ATA	2	6	6591	6596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020248	CAA	2	6	6635	6640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020248	T	6	6	6677	6682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020248	TAAT	2	8	6733	6740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020248	TGTTT	2	10	6762	6771	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020248	GAAT	2	8	6853	6860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020248	GAA	2	6	6882	6887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020248	AAT	2	6	16852	16857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020248	TTA	2	6	16932	16937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020248	AAT	2	6	17010	17015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020248	TAAA	2	8	17026	17033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020248	TTTC	2	8	17683	17690	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020248	AG	3	6	17699	17704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020248	A	6	6	18684	18689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020248	T	6	6	18740	18745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020248	GTT	2	6	20323	20328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020248	TCC	2	6	20329	20334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_020248	TTA	2	6	20339	20344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020248	T	6	6	20378	20383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020248	TCT	2	6	20387	20392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020248	AAT	2	6	20400	20405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020248	TAA	2	6	21723	21728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020248	T	8	8	21770	21777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020248	TAA	2	6	21787	21792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020248	ACTT	2	8	23761	23768	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020248	T	7	7	23803	23809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020248	TGA	3	9	23844	23852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020248	AAG	2	6	23889	23894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020248	ATT	2	6	26532	26537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020248	T	7	7	26575	26581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020248	TTAA	2	8	26594	26601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020248	TTC	2	6	26611	26616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020248	TATT	2	8	26651	26658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020248	ATTA	2	8	26663	26670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020248	GAAT	2	8	29622	29629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020248	TGC	2	6	29641	29646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020248	GAA	2	6	29677	29682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020248	GAA	2	6	29688	29693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020248	AAT	2	6	29706	29711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020248	TAA	2	6	29762	29767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020248	AGAA	2	8	29787	29794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020248	CGT	2	6	30269	30274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020248	T	6	6	30285	30290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020248	T	6	6	30298	30303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020248	A	6	6	30333	30338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020248	TTTC	2	8	31645	31652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020248	AGG	2	6	31739	31744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020248	T	6	6	31763	31768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020248	TC	3	6	31845	31850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020248	AGA	2	6	31962	31967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020248	CTT	2	6	31977	31982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020248	TCTA	2	8	32049	32056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020248	ATT	2	6	32111	32116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020248	A	6	6	32355	32360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020248	AATT	2	8	32370	32377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020248	AAT	2	6	32399	32404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020248	TTAA	2	8	32410	32417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020248	TTTA	2	8	33112	33119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020248	TTC	2	6	33187	33192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020248	AAGG	2	8	33383	33390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020248	T	6	6	33422	33427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020248	AAG	2	6	33447	33452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020248	A	6	6	33503	33508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020248	TTAA	2	8	33512	33519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020248	TGT	3	9	33526	33534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020248	AGAT	2	8	33555	33562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020248	AAG	2	6	33571	33576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020248	ATTTAA	2	12	33594	33605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020248	TGG	2	6	34228	34233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020248	ATAAA	2	10	34282	34291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020248	A	6	6	34300	34305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020248	TTC	2	6	37590	37595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020248	TTC	2	6	37631	37636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020248	TGC	2	6	37679	37684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020248	TC	3	6	37741	37746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020248	TCAA	2	8	37780	37787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020248	AGA	2	6	37867	37872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020248	TAT	2	6	38102	38107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020248	ATC	2	6	39301	39306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020248	TTTTTA	2	12	39394	39405	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020248	GAA	2	6	39478	39483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020248	TTA	2	6	42384	42389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020248	GAA	2	6	42406	42411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020248	TAG	2	6	43384	43389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020248	GGA	2	6	43398	43403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020248	GTT	2	6	43447	43452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020248	TA	3	6	52213	52218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020248	GAT	2	6	52229	52234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020248	TCG	2	6	52296	52301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020248	TTG	2	6	52311	52316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020248	T	6	6	52327	52332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020248	T	9	9	52358	52366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020248	GTC	2	6	52412	52417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020248	A	6	6	52448	52453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020248	TTTTG	2	10	52483	52492	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020248	AAG	2	6	52512	52517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020248	CTT	2	6	52569	52574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020248	AAAG	2	8	52606	52613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020248	TTTA	2	8	52616	52623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020248	GAAG	2	8	52720	52727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020248	CCT	2	6	52730	52735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_020248	T	7	7	52742	52748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020248	TGC	2	6	52803	52808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020248	CCT	2	6	52809	52814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_020248	AGG	2	6	52834	52839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020248	AGAA	2	8	54476	54483	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020248	T	6	6	54489	54494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020248	AAT	2	6	54516	54521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020248	AAAG	2	8	54773	54780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020248	GTT	2	6	57767	57772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020248	TGG	2	6	57847	57852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020248	TTAAT	2	10	57951	57960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020248	TAA	2	6	59643	59648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020248	AGA	2	6	59719	59724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020248	GTTT	2	8	59879	59886	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020248	TATG	2	8	59894	59901	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020248	CTA	2	6	59958	59963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020248	TCG	2	6	60822	60827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020248	GAA	2	6	60873	60878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020248	A	6	6	60941	60946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020248	CCT	2	6	60994	60999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_020248	GAG	2	6	61019	61024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020248	ATT	2	6	61027	61032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020248	TAA	2	6	61044	61049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020248	TCT	2	6	61072	61077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020248	ATA	2	6	61088	61093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020248	GTTG	2	8	61148	61155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020248	AGA	2	6	61213	61218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020248	TAT	2	6	61237	61242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020248	GAG	2	6	61246	61251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020248	ATT	2	6	61268	61273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020248	AAT	2	6	61339	61344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020248	TTA	2	6	61375	61380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020248	TTGTTC	2	12	61407	61418	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_020248	AGC	3	9	61487	61495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_020248	TCA	2	6	61512	61517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_020248	T	6	6	61564	61569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020248	GA	3	6	61834	61839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020248	AGC	2	6	61841	61846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020248	GAA	2	6	61879	61884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020248	TCG	2	6	61908	61913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_020248	TCTG	2	8	61996	62003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_020248	TTC	2	6	62085	62090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_020248	AG	3	6	62122	62127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020248	GCG	2	6	62212	62217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_020248	TTATGG	2	12	62229	62240	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020248	GCA	2	6	62269	62274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_020248	AAG	2	6	62324	62329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020248	TTA	2	6	62375	62380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020248	T	7	7	62427	62433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_020248	TC	3	6	62574	62579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
166	NC_020248	GCT	2	6	62605	62610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_020248	ATTTGG	2	12	62613	62624	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_020248	GCTT	2	8	62642	62649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
169	NC_020248	GCA	2	6	62721	62726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_020248	CTG	2	6	62753	62758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_020248	ATG	2	6	62761	62766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_020248	TAGTT	2	10	62802	62811	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_020248	GAATG	2	10	62818	62827	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
174	NC_020248	CTC	2	6	62846	62851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_020248	GAA	2	6	62856	62861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020248	AAC	2	6	62940	62945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_020248	CAT	2	6	62988	62993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_020248	TTG	2	6	63122	63127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
180	NC_020248	GACGC	2	10	63158	63167	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
181	NC_020248	GAT	2	6	63186	63191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020248	AAAGAA	2	12	63210	63221	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
183	NC_020248	TCTA	2	8	63230	63237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
184	NC_020248	CAA	2	6	63283	63288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_020248	TG	3	6	63292	63297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_020248	TTG	2	6	64364	64369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_020248	A	7	7	64374	64380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_020248	GAA	2	6	64391	64396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_020248	CTTT	2	8	64554	64561	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
191	NC_020248	AAT	2	6	64622	64627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_020248	GT	3	6	68152	68157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
193	NC_020248	AGA	2	6	68166	68171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
194	NC_020248	TAA	2	6	68186	68191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_020248	CTG	2	6	68227	68232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_020248	CTA	2	6	68233	68238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_020248	TAC	2	6	68285	68290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_020248	CTT	2	6	68320	68325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_020248	GAG	2	6	69379	69384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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218	NC_020248	ATTATA	2	12	77737	77748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_020248	TCC	2	6	83322	83327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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283	NC_020248	AAT	2	6	83408	83413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020248	AGT	2	6	83421	83426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_020248	CAAG	2	8	84814	84821	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
287	NC_020248	AGAAA	2	10	87330	87339	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
288	NC_020248	GTT	2	6	87359	87364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_020248	TTTA	2	8	87370	87377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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